孙家鼐（1898.7-1900.春）

　　许景澄（1900.春-1900.8）

　　张百熙（1902.1-1904.1）

　　张亨嘉（1904.1-1906.2）

　　李家驹（1906.3-1907.8）

　　朱益藩（1907.8-1908.1）

　　刘廷琛（1908.1-1910.12）

　　柯劭愍（1910.12-1911.12）

　　劳乃宣（1911.12-1912.2）

　　严复（1912.2-1912.10）

　　章士钊（1912.10-1912.12）

　　何燮侯（1912.12-1913.11）

　　胡仁源（1913.11-1916.12）

　　蔡元培（1916.12-1927.7）

　　刘哲（1927.8-1928.6）

　　李煜嬴（1928.6-1929.1）

　　陈大齐（1929.1-1929.8）

　　蔡元培（1929.9-1930.12）

　　蒋梦麟（1930.12-1945.10）

　　胡适（1945.10-1948.12）

　　汤用彤（1949.5-1951.9）

　　马寅初（1951.9-1960.3）

　　陆平（1960.3-1966.5）

　　周培源（1978.7-1981.3）

　　张龙翔（1981.6-1984.3）

　　丁石孙（1984.3-1989.8）

　　吴树青（1989.8-1996.8）

　　陈佳洱（1996.8-1999.11

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